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主管单位 工业和信息化部 主办单位 哈尔滨工业大学 主编 任南琪 国际刊号ISSN 1672-5565 国内刊号CN 23-1513/Q

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引用本文:王敬敬,赵维,黄志勇.用于寡核苷酸探针设计的ARB软件[J].生物信息学,2017,15(2):127-133.
WANG Jingjing,ZHAO Wei,HUANG Zhiyong.A brief introduction to the ARB software for the design of oligonuc-leotide probes[J].Chinese Journal of Bioinformatics,2017,15(2):127-133.
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用于寡核苷酸探针设计的ARB软件
王敬敬,赵维,黄志勇
(天津市工业生物系统与过程工程重点实验室(中国科学院天津工业生物技术研究所),天津300308)
摘要:
探针设计是制备高质量基因芯片的重中之重。ARB软件是用于设计系统发育芯片(PhyloChip)探针的主要软件,然而由于安装困难、相关中文文章较少等原因,阻碍了其在国内的广泛使用。本文详细介绍了ARB软件的安装方法、探针设计及其他功能。这将有助于用户快速使用ARB软件进行探针设计,促进系统发育芯片的发展及其在各领域的应用。
关键词:  ARB软件  探针设计  基因芯片
DOI:10.3969/j.issn.1672-5565.20161115001
分类号:Q341
文献标识码:A
基金项目:国家自然科学基金(31500424);中国科学院科技服务网络计划(STS计划)项目(KFJ-SW-STS-143-6);天津市科技计划项目(15ZCZDSF00620);宁波大学水产浙江省重中之重一级学科开放基金(xkzsc10).
A brief introduction to the ARB software for the design of oligonuc-leotide probes
WANG Jingjing, ZHAO Wei, HUANG Zhiyong
(Tianjin Key Laboratory for Industrial Biological Systems and Bioprocessing Engineering(Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences), Tianjin 300308, China)
Abstract:
Probe design is the most important part for the preparation of high quality gene chip. ARB software is the main software used to design probes for the phylogenetic oligonucleotide gene chip (PhyloChip). This paper introduced the installation, probe design using ARB software, and other functions of ARB software. This will help users to design probe quickly using the ARB software, and promote the development and application of PhyloChip.
Key words:  ARB software  Probe design  Gene chip

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