| 缺铁水稻根转录本微点阵分析 |
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| 引用本文： | 孙彤,闫莉婕,黄勤妮,印莉萍.缺铁水稻根转录本微点阵分析[J].生物信息学,2004,2(3):1-5. |
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| 作者姓名： | 孙彤 闫莉婕 黄勤妮 印莉萍 |
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| 作者单位： | 首都师范大学,生物系,北京,100037 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究专项基金 (19990 1170 0 )，国家自然科学基金项目(3 0 170 5 5 2 )，北京市自然科学基金项目 (5 0 42 0 0 4)，北京市教委资助项目(KM2 0 0 410 0 2 80 15 ) |
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| 摘 要： | 水稻不仅是非常重要的粮食作物 ,也是用于研究的模式植物之一 .由于水稻基因组测序的完成 ,用功能基因组学的现代方法来研究缺铁相关基因的表达调控是最高效的方法之一。在前期工作的基础上 ,精心设计了缺铁和EDTA鳌合二价铁诱导5天的水稻根实验 ,并进行了转录水平的微点阵 (microarray)分析。但只获得了第 5天的结果。在 10 5 31个水稻cDNA芯片图谱中 ,缺铁和加铁比较发现了 4 5 1个差异点。对缺铁诱导的 4 5 1个差异cDNA逐一地进行NCBI (美国国家生物技术信息中心 )的BLAST(局部定位排列搜索工具 )数据库检索、分析和归类。发现其中缺铁与加铁 ( -Fe/Fe -EDTAratio)之间的相对表达水平(REL)在 2 - 9.175之间的缺铁诱导上调基因为 2 0 3个 ,缺铁诱导的下调基因为 2 4 8个。对每一类上调基因都逐一地进行了NCBI-PubMed的文献检索。利用国际网络数据库进行了功能鉴定。
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| 关 键 词： | 微点阵 转录本组图谱 缺铁胁迫 水稻根 |
| 文章编号： | 1672-5565(2004)-03-0001-05 |
| 修稿时间： | 2003年12月23 |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
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